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Phénotypage

Animateurs : Alice Fatet, Léa Lansade, Christine Leterrier et Christophe Staub
Conjointement au projet ATO (ontologie du phénotypage) mis en place par le département PHASE, la transversalité “Phénotypage“ a pour but de commencer un travail d’identification systématique d’animaux présentant des caractéristiques phénotypiques particulières voire extrêmes. Il s’agira, toutes espèces confondues, de les répertorier, d’évaluer la répétabilité puis l’héritabilité du caractère en question, ce qui passe par l’examen des animaux qui leur sont apparentés (demi-frères ou sœurs, parents, descendants…) et qui présentent les mêmes caractéristiques phénotypiques. Le but à terme est d’inférer des relations phénotype/génotype, à l’heure du génotypage et du séquençage à très haut débit, animal par animal. Evidemment les recommandations issues du programme ATO seront scrupuleusement suivies, dès qu’elles seront précisées.

Cette action fédératrice est l’occasion de resserrer les liens entre UE et UR, puisqu’elle concerne et intéresse les animaliers de l’UEPAO mais aussi les chercheurs, ingénieurs et techniciens de l’UR. Tous, à leur niveau, ont en effet accès à une variabilité phénotypique très diverse, comme celle du comportement et de l’émotivité des animaux, de la congélabilité du sperme, du nombre de follicules ovariens en croissance chez la vache, de la longueur du tractus génital chez la truie, de la période d’entrée en anoestrus etc… Les exemples sont foison.

En plus de réunions de travail qui devraient être régulières, un bilan annuel pourrait être prévu, sous la forme d’une demi-journée ou d’une journée d’échange assez inédit UEPAO → UMR PRC (éventuellement reconductible d’année en année au même titre que les journées thésards).

Voir aussi

1ère réunion de la tranversalité "Phénotypage" du 27 janvier 2011 : Présentation (PDF) de Christophe Staub (ingénieur phénotypage)
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Rédaction : Alice Fatet, Léa Lansade, Christine Leterrier et Christophe Staub
Date de création : 30 Août 2010
Mise à jour : 10 Avril 2012