Leur impact économique annuel dépasse 2 millions d’euros dans les élevages laitiers français, auxquels s’ajoute une somme équivalente pour la branche AI en raison des surcoûts de mise en place des IA sur retours en chaleurs. La fréquence des échecs de reproduction est corrélée avec les caractéristiques génétiques de production laitière, ce qui explique l’impact défavorable sur la fertilité d’une sélection uniquement orientée sur ces caractères. La qualité de l’ovocyte constitue le principal facteur limitant de l’établissement de la gestation. Les études in vitro ont montré que l’ovocyte acquiert séquentiellement en fin de folliculogenèse d’abord sa capacité à accomplir la méiose, puis sa compétence à soutenir le développement précoce. Ces propriétés sont associées à l'activation d'un répertoire caractéristique de gènes et à une régulation précise de la stabilité des transcrits et de leur traduction en protéine. Grâce au développement de la génomique et de la bio-informatique, l’étude du transcriptome des cellules germinales dans les espèces modèles (drosophile, souris) connaît depuis ces dernières années un essor spectaculaire. Elle met en évidence le rôle crucial de certains gènes précisément au cours de la maturation de l’ovocyte et au début du développement embryonnaire.

1) la création d’outils de génomique expressionnelle spécifiques

2) la précision des phénotypes des animaux supports des études de génomique expressionnelle comparative, en termes de potentiel de reproduction sur les plans quantitatif (croissance folliculaire, nombre d’ovocytes) et qualitatif (aptitude à la fécondation et au développement précoce) et l’étude de l’héritabilité de ces traits

3) leur utilisation pour suivre l’expression d’un large répertoire de gènes d’intérêt en association avec le potentiel de développement embryonnaire.