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Plasticité Génomique et Expression Phénotypique

 

  • Légende de l'image bleue : Agrégats cytoplasmique de transposase mariner surexprimée dans des cellules HeLa
  • Légende de l'image à fond blanc : Logo de la séquence consensus des intéines s'intégrant dans le site Pol1 des ADN polymérases de phycodnavirus
© Yves Bigot


Animateur de l'équipe


Yves Bigot

 

Objectifs généraux


Le projet de l’équipe est organisé autour de deux objectifs. Le premier est d’identifier les éléments génétiques mobiles (EGMs) capables de transposer et de modifier l’expression génique lors de reprogrammations chromatiniennes. Le second est de vérifier si les mécanismes épigénétiques régulant l’activité des EGMs et l’émergence de variabilité génétique dans les autres modèles animaux sont présents chez les oiseaux.
 


Enjeux socio-économiques


La finalité de nos activités de recherche est d’identifier le ou les EGMs qui sont activés dans les espèces aviaires domestiques lors de certains processus de différenciation cellulaires, gamétogenèse et spermatogenèse, ou à la suite de stress ou de traitements. Une exploitation possible des résultats de notre projet pourra être l’établissement de marqueurs permettant de suivre et de quantifier la génotoxicité d’un traitement ou d’un stress sur ces animaux.


Publications majeures récentes


Worden AZ, Lee JH, Mock T, Rouzé P, Simmons MP, Aerts AL, Allen AE, Cuvelier ML, Derelle E, Everett MV, Foulon E, Grimwood J, Gundlach H, Henrissat B, Napoli C, McDonald SM, Parker MS, Rombauts S, Salamov A, Von Dassow P, Badger JH, Coutinho PM, Demir E, Dubchak I, Gentemann C, Eikrem W, Gready JE, John U, Lanier W, Lindquist EA, Lucas S, Mayer KF, Moreau H, Not F, Otillar R, Panaud O, Pangilinan J, Paulsen I, Piegu B, Poliakov A, Robbens S, Schmutz J, Toulza E, Wyss T, Zelensky A, Zhou K, Armbrust EV, Bhattacharya D, Goodenough UW, Van de Peer Y, Grigoriev IV. 2009. Green evolution and dynamic adaptations revealed by genomes of the marine picoeukaryotes Micromonas. Science. 324(5924):268-272.

Roulin A, Chaparro C, Piégu B, Jackson S, Panaud O. 2010. Paleogenomic analysis of the short arm of chromosome 3 reveals the history of the African and Asian progenitors of cultivated rices. Genome Biol Evol. 2010 Feb 11;2:132-9

Bigot Y, Jegot G, Casteret S, Aupinel P, Tasei JN. 2011. DNA modifications and genome rearrangements during the development and sex differentiation of the bumble bee, Bombus terrestris. Insect Molecular Biology. 20:165-175.

Demattei MV, Hedhili S, Sinzelle L, Bressac C, Casteret S, Moiré N, Cambefort J, Thomas X, Pollet N, Gantet P, Bigot Y. 2011. Nuclear importation of Mariner transposases among eukaryotes: motif requirements and homo-protein interactions. PLoS One. 6(8):e23693.

Palazzoli F, Bire S, Bigot Y, Bonnin-Rouleux F. 2011. Landscape of chromatin control element patents: positioning effects in pharmaceutical bioproduction. Nat Biotechnol. 29(7):593-7.
 
Rédaction : Yves Bigot
Date de création : 27 Janvier 2012
Mise à jour : 27 Janvier 2012